公司规定辞职后有三个月的等待期才能离职，合

公司规定三个月等待期离职不合法。依据《劳动合同法》，劳动者与用人单位协商或提前通知即可解除，无需等待三个月。不及时处理可能损害劳动者权益，如影响新工作入职等。
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公司规定不合法。处理方式：1.与公司协商，表达离职意愿并了解离职流程；2.若协商无果，提前三十日（试用期三日）书面通知公司离职，保留证据；3.如公司拒绝，可申请劳动仲裁，依据《劳动合同法》维护权益。
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对此情况，劳动者可与用人单位协商解除或提前通知解除。若协商无果，应选择提前三十日（试用期提前三日）书面通知用人单位解除劳动合同。